تواجه شركة السكر مصاعب مالية وإدارية منذ سنوات بعد انسحاب الشريك الرئيسي في المشروع "شركة الكنانة السودانية" إثر مطالبة المدير السابق للمشروع الدي ولد الزين السودانيين بالتنازل عن صحة 5% التي يمنحهم الاتفاق مع الجانب الموريتاني مقابل خبرة الشركة.